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blosum矩阵的数值是怎么来的

提问: 留学新天地 分类:精选问答

优质回答

留学新天地

Blosum矩阵是一种用于比对蛋白质序列的替代矩阵。

它的数值是通过对已知的蛋白质序列进行比对和分析得出的。具体来说,Blosum矩阵的数值是通过统计已知的蛋白质序列中的氨基酸替代情况来计算得出的。研究人员会收集大量的蛋白质序列比对数据,并统计在比对过程中不同氨基酸之间的替代频率。根据这些统计数据,可以计算出不同氨基酸之间的替代概率。

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模块替代矩阵。矩阵中的每个位点的分值来自蛋白比对的局部块中的替代频率的观察。每个矩阵适合特定的进化距离。例如,在BLOSUM62矩阵中,比对的分值来自不超过62%一致率的一组序列。

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